Головное учреждение БУЗОО «ЦК» располагается в двух корпусах: производственный корпус, где происходит заготовка, переработка и хранение донорской крови и ее компонентов и лабораторный корпус, в подразделениях которого производится лабораторная апробация донорской крови в полном объеме.