К отрицательным сторонам ФГБУ ИМЦУАОСМП Росздравнадзора можно отнести безответственное руководство лабораторией, отсутствие карьерного роста, трудности с обращением в отдел кадров. Конкретный инцидент подчеркнул непрофессионализм заведующей микробиологической лабораторией доктора Авдеевой, которая изначально сочла кандидата подходящим для данной должности, но впоследствии без уважительных причин передумала. С нагрузкой, рассчитанной на пять человек, справляются только два сотрудника, что указывает на потенциальную переутомление и неэффективность внутри компании.