ГЕНПРОЕКТ критиковали за то, что в 2016 году он платил только белую зарплату, давал невыполненные обещания, перегружал сотрудников и имел некомпетентное руководство. Несмотря на начало выплаты черной зарплаты, сотрудников предупреждают о необходимости быть осторожными, поскольку могут возникнуть задержки. Менеджер А.С. Сотскова обвинили в выманивании у сотрудников денег на черную зарплату. Сотрудникам рекомендуется увольняться, если происходят задержки с оплатой.