С 1995 года ВНИИСТ развивается как инжиниринговая нефтегазовая компания и выполняет комплекс научно-исследовательских и инжиниринговых работ на объектах топливно-энергетического комплекса, начиная от разработки нормативно-технической документации и проектирования до технического надзора и контроля качества за строительством объектов. ВНИИСТ становится федеральным научно-технических центром. Постоянное поле деятельности института связано с формированием новой отраслевой нормативной базы от национальных до корпоративных стандартов. Так, например, по заказу Минпромэнерго России институт разработал Генеральные схемы развития нефтепроводного и нефтепродуктопроводного транспорта на период до 2020 года. Среди крупных проектов, реализованных при активном участии ВНИИСТа, — строительство газопроводов Ямал – Европа, Россия – Турция («Голубой поток»), нефтепровода Каспийского трубопроводного консорциума, обустройство Заполярного газоконденсатного месторождения, комплексная газификация Ямало-Ненецкого автономного округа, увеличение мощностей Балтийской трубопроводной системы (БТС) до 50 млн. тонн в год. ВНИИСТ сыграл ключевую роль в управлении проектированием нефтепроводной системы Восточная Сибирь – Тихий океан (ВСТО). В рамках данного национального проекта Институт в 2006-2008 гг. выполнил следующие виды работ: разработка концепций и технических решений; разработка НТД; управление ПИР; выполнение ПИР; организация и проведение общественных слушаний ОВОС; получение согласований, разрешений и экспертиз надзорных органов; организация технического надзора за изготовлением оборудования, изделий и материалов; обучение и аттестация специалистов подрядных организаций; организация авторского надзора; разработка программ методик испытаний и т.д. Труба протяженностью около 4400 км впервые откроет российским экспортерам нефти прямой выход на перспективный рынок Азиатско-Тихоокеанского региона, даст мощный импульс развитию восточных регионов страны. ВСТО – уникальный для мировой практики проект во многих отношениях: и по протяженности, и по сложности маршрута - вечная мерзлота, сейсмоопасные зоны, разломы, оползни, более 700 рек, свыше ста автомобильных и железных дорог, сотни километров болот. Наконец, нефтепровод должен выдерживать давление в 100 атмосфер против прежних 64. Среди других достижений ВНИИСТа последних лет - участие в разработке таких масштабных проектов, как - нефтепроводные системы «Харьяга-Индига» и «Ямал», система магистральных нефтепроводов «Юрубчено-Тохомское месторождение (ЮТМ) – Тайшет». Начало 2008 года ознаменовалось для института переходом на новую ступень развития, связанную с расширением сферы деятельности. ВНИИСТ приступил к решению широкого спектра задач по созданию, капитальному ремонту и техническому перевооружению нефтегазовых объектов. Сегодня объектами деятельности института являются магистральные и промысловые нефтегазопродуктопроводы, технологические трубопроводы, распределительные газопроводы, морские нефтегазопроводы, компрессорные и насосные станции, нефтебазы, нефтегазоперерабатывающие заводы, резервуарные парки, речные и морские терминалы, бензо- и газозаправочные станции.