«МультиЭйр Москва» столкнулась с негативными отзывами из-за того, что в 2009 году занималась подбором персонала в отдел продаж и кондиционирования. На летний сезон компания наняла неопытных и немотивированных сотрудников, что привело к нулевому результату. Позже эти сотрудники были уволены без предупреждения и без зарплаты. На компанию были поданы жалобы на незаконную деятельность, в том числе на нарушение налоговой дисциплины. Компанию критиковали за отсутствие технических ресурсов и невыплату заработной платы сотрудникам. Против «МультиЭйр Москва» были возбуждены судебные иски, в том числе судебные.