В 1949 г. постановлением Совета Министров СССР в составе института «Гидропроект» был создан Научно-исследовательский сектор (НИС) с присвоением ему прав всесоюзного научно-исследовательского института. Развитие НИСа определялось задачами, стоящими перед гидроэнергетикой страны. В 1991 г . – НИС Гидропроекта преобразован в Научно-исследовательский институт энергетических сооружений (НИИЭС). В 1994 г . образование Открытого акционерного общества «Научно- исследовательский институт энергетических сооружений» в составе ОАО РАО «ЕЭС России» – ОАО «НИИЭС». В 2006 г. институт включен в состав ОАО «ГидроОГК» в соответствии со специальным Распоряжением Председателя Правительства РФ М. Фрадкова.