Сотрудники НПЦ «ИНФОТРАНС» выразили обеспокоенность по поводу различных негативных сторон деятельности компании. К ним относится отсутствие индексации заработной платы при общем пренебрежительном отношении к этому вопросу. Оплата сверхурочной работы предусмотрена только в особых случаях, а раздутый штат дирекции подвергается критике. Кроме того, есть жалобы на ограниченные возможности карьерного роста, если он не связан с руководством, зарплаты ниже рыночных, неадекватное лидерство и плохие меры безопасности на рабочем месте.