Автономная некоммерческая организация «Юридическое управление» была создана в 2006 году. Учредителями являются Сибирское отделение Российской академии сельскохозяйственных наук (СО РАСХН, ВАСХНиЛ) и Новосибирская Аудиторская Палата.
Изначально целью АНО «Юридическое управление» было содействие подведомственным учредителям организациям в организации и проведении открытых конкурсов в рамках 94-ФЗ «О размещении заказов на поставки товаров, выполнение работ, оказание услуг для государственных и муниципальных нужд» по отбору аудиторских организации для проведения обязательного ежегодного аудита финансовой (бухгалтерской) отчетности.
Со временем в АНО «Юридическое управление» стали обращаться и другие государственные компании с долей собственности государства более 25% с просьбой провести для них процедуру открытого конкурса и выбрать надежного поставщика услуг.
После принятия федерального закона от 18.07.2011 № 223-ФЗ «О закупках товаров, работ, услуг отдельными видами юридических лиц»