Негативные отзывы о ВНИПИнефть подчеркивают такие проблемы, как кумовство на руководящих должностях, непрофессионализм и жестокое обращение с сотрудниками. Компанию описывают как неорганизованную, с упором на концептуальные проекты, а не на правильные процессы проектирования. Сотрудники сообщают о токсичной рабочей среде, строгом контроле рабочего времени и низкой оплате труда. Имеются обвинения в неэтичном поведении руководства, включая манипуляции и жестокое обращение с персоналом. В целом компания изображается хаотичной и лишенной надлежащего управления и поддержки сотрудников.