Центр осуществляет свою деятельность во взаимодействии с Федеральными органами государственной власти, органами государственного управления субъектов Российской Федерации, местного самоуправления, организациями, специалистами хозяйств, садоводами и гражданами. Центр действует на основании Устава, в соответствии с Конституцией Российской Федерации, федеральными конституционными законами Российской Федерации, федеральными законами Российской Федерации, указами и распоряжениями Президента Российской Федерации, постановлениями и распоряжениями Правительства Российской Федерации, иными нормативными правовыми актами Российской Федерации, приказами Минсельхоза России.