АО «НИИТФА» подверглось критике за выплату низкой заработной платы большому количеству сотрудников, не занимающихся активной предпринимательской деятельностью. Сообщается, что многие сотрудники тратят время на работе, занимаясь не связанными с работой видами деятельности, такими как употребление алкоголя, частые перекуры и общее безделье. Такая низкая производительность объясняется частично некомпетентностью управленческой команды, которая больше ориентирована на личную выгоду и амбиции, а не на продвижение компании вперед.