ООО «Национальное агентство клинической фармакологии и фармации» подверглось критике за различные негативные моменты. Сотрудники сообщали о нарушениях Трудового кодекса, задержках зарплаты, внутренних конфликтах и неуважительном отношении со стороны руководства. Высказывались также опасения по поводу источника «черных денег», используемых для выплаты заработной платы, отсутствия перспектив развития и постоянного перекладывания вины со стороны владельцев. Компания испытывает финансовые трудности и полагается на вливания сомнительных средств, чтобы остаться на плаву. В целом компания столкнулась с серьезными проблемами и недовольством среди своих сотрудников.