АНОО «Физтех-лицей» имени П. Л. Капицы получила неоднозначные отзывы, в частности, подчеркивая некоторые негативные аспекты. Недавний отчет посетителя показывает, что впечатляющее присутствие школы в Интернете не отражает реальность, испытываемую на месте. Образовательная среда, описанная как похожая на среду любой обычной школы, не обладает исключительными качествами, которые можно было бы ожидать от учреждения для «одаренных» детей. Манера поведения руководства воспринимается как высокомерная, а общая атмосфера характеризуется провинциальным мышлением среди персонала. Хотя школа может похвастаться современной и красивой инфраструктурой, отмечается, что уровень коммерциализации довольно высок, что может отвлекать от образовательного опыта.